यरवदा सेंट्रल जेल से रिहा होने के बाद, सईद अहमद मोहम्मद देसाई को सहकारनगर पुलिस स्टेशन में रखा गया था, जब वह 23 जनवरी, 2008 को भाग निकले थे, तब उनका निर्वासन लंबित था।
उन्होंने किराए पर एक घर लिया और एक अलग नाम के तहत ड्राइविंग लाइसेंस, एक राशन कार्ड और यहां तक कि एक भारतीय पासपोर्ट भी प्राप्त किया। वह अपने बेटे के लिए एक प्रमुख स्कूल में प्रवेश और अपनी बेटी के लिए जन्म प्रमाण पत्र प्राप्त करने में कामयाब रहे।
सईद अहमद मोहम्मद देसाई के लिए पुणे में एक नया जीवन शुरू करने के लिए सभी चीजें सही थीं। 14 जून, 1999 तक, जब पुणे सिटी पुलिस इंस्पेक्टर सुरेंद्र बापू पाटिल को “किसी” द्वारा “पाकिस्तान को गुप्त सूचना” भेजने के बारे में सूचना मिली और उन्होंने कात्रज-कोंधवा रोड पर कंचन प्लाजा में अपने निवास से एक व्यक्ति को गिरफ्तार किया। वह तब 38 साल के देसाई थे।
पुलिस ने पाया कि देसाई मूल रूप से कराची का निवासी था और पाकिस्तान की इंटर सर्विसेज इंटेलिजेंस (आईएसआई) का एजेंट था। उन्होंने उसके पास से भारतीय सेना के जवानों के लिए “हथियारों के प्रशिक्षण” से संबंधित “प्रतिबंधित” चिह्नित वर्गीकृत दस्तावेज़ और अधिकारियों की एक सूची बरामद की। उन्होंने यह भी पाया कि वह “यूसुफ और खुर्रम” के रूप में पहचाने गए पाकिस्तानी सैन्य खुफिया अधिकारियों के निर्देशों पर काम कर रहा था।
